Noua etapă a pandemiei: tulpina periculoasă „Delta”

2024 Autor: Seth Attwood | [email protected]. Modificat ultima dată: 2023-12-16 16:15

Noua tulpină indiană covid-19, numită deja de oamenii de știință „Delta”, a dat naștere celui de-al treilea val al pandemiei în multe țări. În New Delhi, situația este pur și simplu catastrofală - 30.000 de cazuri pe zi. Institutele au început să studieze „Delta” și imediat au tras un semnal de alarmă.

Noua tulpină s-a dovedit a fi nu numai mai infecțioasă, ci și mai puțin vulnerabilă la anticorpi. Aceasta înseamnă că poate rezista cu succes „contraatacurilor” pe care sistemul nostru imunitar le va conduce împotriva lui.

Când varianta coronavirusului, numită acum „Delta”, a apărut pentru prima dată în statul indian Maharashtra în decembrie 2020, nu părea să fie ceva special. Dar când a lovit New Delhi câteva luni mai târziu, consecințele au fost cele mai devastatoare, cu aproape 30.000 de cazuri în fiecare zi la sfârșitul lunii aprilie. „Deodată, a început să domine și a zdrobit complet tulpina Alpha, care până atunci era cea mai răspândită în oraș”, spune Anurag Agrawal, șeful Institutului de Genom și Biologie Integrativă din New Delhi.

New Delhi părea puțin probabil să se confrunte cu un alt focar major, a spus Agrawal, deoarece mulți dintre locuitorii săi erau fie bolnavi, fie vaccinați. Dar s-a dovedit că aceste mijloace de apărare împotriva Deltei sunt neputincioase. Este mai contagioasă și scapă de sistemul imunitar, spune el: „Zedul de trei metri din jurul orașului pare să se fi transformat într-unul de jumătate de metru, peste care nu este greu să treci peste”.

Din New Delhi, tulpina sa răspândit rapid și acum pare să măture globul cu un nou val devastator. În Marea Britanie, Delta reprezintă deja peste 90% dintre cazurile noi: acest lucru a făcut ca numărul de cazuri de coronavirus să crească din nou după o scădere bruscă, iar săptămâna trecută guvernul a fost chiar nevoit să amâne faza finală a planului său de deschidere a frontierei.. Izbucnirea Deltei de la Lisabona a forțat guvernul portughez să impună o interdicție de trei zile de călătorie între capitală și restul țării.

Până la sfârșitul lunii august, această opțiune va reprezenta până la 90% din toate cazurile de coronavirus din Uniunea Europeană, a avertizat astăzi șefa Centrului European pentru Prevenirea și Controlul Bolilor, Andrea Ammon. „Este foarte probabil ca tulpina Delta să se răspândească pe scară largă în timpul verii, în special în rândul tinerilor care nu fac parte din programul de vaccinare”, a spus ea. „Acest lucru ar putea expune cetățenii mai vulnerabili la riscul de a se îmbolnăvi grav sau chiar de a muri. dacă nu sunt complet vaccinați.”

Cursele Delta au fost înregistrate în Rusia, Indonezia și multe alte țări. În SUA, unde prevalența tulpinii este estimată a fi de cel puțin 14%, CDC a declarat pe 15 iunie că este „de cea mai mare îngrijorare”.

Creșterea a declanșat o serie de studii pentru a înțelege de ce Delta se răspândește mult mai repede decât celelalte trei variante îngrijorătoare, dacă altfel este mai periculoasă, și cum setul său unic de mutații care provoacă schimbări în mediul proteic poate provoca daune grave. Sosirea Deltei a evidențiat faptul că virusul SARS-CoV-2 se poate adapta și evolua în următoarele luni și ani.

În acest moment, Delta reprezintă o amenințare deosebită pentru țările cele mai sărace, al căror acces la vaccinuri este limitat sau complet absent, spune Sumya Shwaminathan, consilier științific șef al Organizației Mondiale a Sănătății. „Ceea ce mă îngrijorează cel mai mult este ce se va întâmpla când Delta va ajunge în Africa”, spune ea.

Un studiu realizat de Public Health England a evidențiat potențialul de proliferare al Deltei. Comparativ cu Alpha, care a fost lansat în Marea Britanie în 2020, „avem cu 50% sau 100% mai multe transmisii”, spune Adam Kucharski, un dezvoltator de modele la London School of Hygiene and Tropical Medicine.

Dar Kuharsky mai spune că scăderea protecției față de vaccinuri ar fi putut afecta. Vaccinurile Pfizer-BioNTech și AstraZeneca oferă o protecție puțin mai mică împotriva infecțiilor simptomatice cu noua variantă decât pentru tulpina Alpha, pe baza datelor din Anglia și Scoția. Oamenii cu o singură lovitură sunt deosebit de vulnerabili - la fel ca mulți din Marea Britanie. (Două doze din orice vaccin vor oferi în continuare același nivel ridicat de protecție împotriva spitalizării, chiar și împotriva Delta.) Cât de bine protejează alte vaccinuri utilizate în întreaga lume nu este clar și există puține dovezi de protecție a celor care s-au recuperat după valurile anterioare de coronavirus.

Ambele efecte - transmiterea crescută și evaziunea imunității - sunt greu de separat unul de celălalt, dar șeful Wellcome Trust, Jeremy Farrar, consideră că transmisia se află în spatele saltului Delta, nu a bypass-ului imunitar. „Dacă Alpha este cu aproximativ 50% mai transmisibil decât tulpina naturală, iar Delta este încă cu 50%, atunci vorbim despre un virus care este de două ori mai transmisibil decât tulpina originală”, explică un virolog evoluționist de la Universitatea Oxford Aris Katzourakis.

Acest lucru va însemna că țările și populațiile cu rate scăzute de vaccinare s-ar putea confrunta cu noi focare mari. „Dacă răspândirea mai rapidă se datorează în întregime bazelor virusului, atunci aceasta este o veste dezastruoasă pentru restul lumii”, spune Kuharski.

În plus, Delta are mai multe șanse să trimită cetățenii nevaccinați la spital decât Alpha. Datele timpurii din Marea Britanie sugerează că riscul de spitalizare ar putea fi de două ori mai mare. Luate împreună, aceste caracteristici ar putea cauza probleme uriașe în Africa, a spus Schwaminathan. „Nu va fi oxigen, nu vor fi suficiente paturi de spital. Și știm deja că rezultatele spitalelor din Africa sunt mai rele decât în alte țări, spune ea. „Deci poate duce cu adevărat la rate mai mari ale mortalității chiar și în rândul tinerilor”.

Mutațiile interferează cu anticorpii

Oamenii de știință tocmai au început să-și dea seama de ce Delta este atât de periculoasă. Ei s-au concentrat pe un set de nouă mutații într-o genă care codifică o proteină spike care sondează suprafața și permite virusului să intre în celulele umane. O mutație importantă, denumită P681R, schimbă un aminoacid chiar lângă locul de scindare a furinei, unde o enzimă umană scindează proteina - un pas cheie care permite virusului să intre în celulele umane.

În tulpina Alpha, această mutație a făcut clivajul mai eficient. Potrivit unei publicații preliminare de la sfârșitul lunii mai, mutațiile Delta fac și mai ușor descompunerea furinei. Cercetătorii speculează că acest lucru ar putea crește și transmisibilitatea virusului.

Cu toate acestea, cercetătorii japonezi care au creat pseudovirusuri purtătoare de aceeași mutație nu au confirmat infectiositatea crescută în condiții de laborator, iar în India, alte variante ale coronavirusului cu aceeași mutație s-au dovedit a fi mult mai puțin infecțioase decât Delta, spune virologul evoluționist de la Universitate. din Edinburgh, Andrew Rambaut). „Deci trebuie să existe interacțiune cu altceva în genom”.

Alte mutații Delta pot ajuta la subminarea imunității. Unele dintre ele modifică domeniul N-terminal al coloanei vertebrale (NTD) care iese din suprafața proteinei. Într-un articol recent din revista Cell, a fost dezvăluit că unul dintre punctele NTD, denumit „super-site”, vizează invariabil anticorpii neutralizanți „super-potenți” de la pacienții recuperați. Mutațiile unice Delta îndepărtează aminoacizii din pozițiile 156 și 157 ale „superfrecvenței” și schimbă aminoacidul 158 din arginină în glicină - acesta din urmă eliminând punctul de contact direct pentru legarea anticorpilor, explică biologul structural de la Universitatea din Florida, David Ostrov.

„Credem că mutația 157/158 este una dintre mutațiile Delta distinctive care au dat tulpinii acest fenotip de evaziune a imunitații”, este de acord Trevor Bedford, un biolog computer la Centrul de Cercetare a Cancerului Fred Hutchinson.

O altă mutație în super-regiune NTD poate lupta, de asemenea, împotriva anticorpilor. Iar oamenii de știință ar trebui să înceapă să studieze rolul modificărilor în alte proteine Delta, spune Nevan Krogan, biolog molecular la Universitatea din California, San Francisco. „Sunt multe lucruri pe care nu le știm despre aceste opțiuni la fiecare nivel. Se pare că rătăcim în întuneric.” De exemplu, „Delta” are mai multe mutații în proteina nucleocapsidă, care îndeplinește multe funcții „ca un cuțit elvețian”, explică virologul David Bauer de la Institutul Francis Crick. Cu toate acestea, va dura luni de zile pentru a experimenta pentru a clarifica.

Vaccinarea accelerată

Între timp, oamenii de știință sunt de acord: sunt necesare acțiuni urgente pentru a opri răspândirea noii variante. „Preocupările Delta ar trebui să ne motiveze să accelerăm cu adevărat vaccinarea și să creștem disponibilitatea vaccinurilor în domeniul în care Delta câștigă amploare”, a spus virologul Angela Rasmussen de la Universitatea din Saskatchewan. Președintele american Joe Biden a cerut americanilor să se vaccineze complet pentru a se proteja de Delta. Ammon a cerut astăzi țărilor europene să accelereze planurile de vaccinare completă a populațiilor vulnerabile.

În plus, a spus ea, este necesar să se mențină restricții pentru ca noua opțiune să nu se răspândească și să nu implice o nouă creștere a morbidității, spitalizărilor și deceselor. Țările cu acces limitat la vaccinuri trebuie să revină la măsuri precum distanțarea fizică și măștile, a spus Rasmussen. Și în Europa, Ammon a îndemnat țările să facă ambele: să mențină restricțiile în timp ce lucrează pentru vaccinarea completă a populațiilor vulnerabile.

Scopul nu este doar salvarea de vieți, ci și prevenirea dezvoltării ulterioare a virusului. Răspândirea Deltei a arătat că oamenii de știință nu sunt în măsură să recunoască noi variante periculoase la timp pentru a le opri răspândirea, spune Emma Hodcroft, virolog la Universitatea din Basel, în ciuda eforturilor globale fără precedent de a urmări evoluția lor în timp real. Ar fi periculos să presupunem că SARS-CoV-2 se va opri acolo, a spus Katsurakis. „Tot ceea ce s-a întâmplat în evoluție de cel puțin două ori este deja un model”, spune el. „Nu aș fi surprins dacă vedem schimbări similare în următorul an sau doi.”